圖為北京市殘聯組織機構圖
機關部室
| 辦公室 | 研究室（北京市人民政府殘疾人工作委員會辦公室） | 人事部 | 計劃財務（審計）部 |
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| 維權部 | 機關黨委（黨建工作部） | 機關紀委 |
直屬單位
| 北京市殘疾人康復服務指導中心 | 北京市殘疾人輔助器具資源中心 | 北京市殘疾人社會保障和就業服務中心 |
| 北京市盲人按摩指導中心 | 北京市殘疾人文化體育指導中心 | 北京市殘疾人維權中心 |
| 北京市無障礙環境建設促進中心 | 北京市殘疾人社會服務指導中心 | 北京市殘疾人事業募捐工作管理中心 |
| 北京市殘聯財務結算中心 | 北京市殘疾人聯合會信息中心 |
專門協會
| 市殘聯盲人協會 | 市殘聯聾人協會 | 市殘聯肢殘人協會 | 市殘聯智力殘疾人及親友協會 |
| 市殘聯精神殘疾人及親友協會 |
社會團體
| 北京市殘疾人福利基金會 | 北京市殘疾人康復協會 |